משקעי השתן ניתנים על ידי "מערך הפסולת המיקרוסקופית, תאית ואחרת, שניתן למצוא בשתן, בריכוזים משתנים בהתאם למצב בריאותו של המטופל. בחינת המשקעים הללו, באמצעות המיקרוסקופ או טכניקות אוטומטיות שהוצגו לאחרונה, מהווה חלק בלתי נפרד מבדיקות שתן מסורתיות, המסוגלות לספק אינדיקציות שימושיות לאבחון של פתולוגיות רבות.
בהתאם לצרכים, במשקע השתן ניתן לחפש ולכמת את נוכחותם של תאי דם, כגון תאי דם אדומים ולבנים, תאי אפיתל, מיקרואורגניזמים וכו '. דגימת השתן נלקחת בבוקר, כי ברגע זה השתן חומצי ומרוכז יותר, ובכך מאפשר זיהוי קל יותר של האלמנטים והתא הצילינדרים. לאחר מכן אנו ממשיכים עם הצנטריפוגה והצביעה בסופו של דבר; הדבר החשוב הוא שהשתן טרי, כדי למנוע עלייה ב- pH ואובדן אלמנטים סלולריים ומאורגנים.
השתן של אנשים בריאים מכיל מספר מצומצם מאוד של תאי דם אדומים (תאי דם אדומים), לויקוציטים (תאי דם לבנים) וצילינדרים. ביחס למורפולוגיה ולהיבטים האיכותניים-כמותיים של יסודות אלה, בדיקת משקעי השתן יכולה לספק אינדיקציות שימושיות לאבחון פתולוגיות חשובות, כגון דלקת השתן, דלקת הערמונית, בלניטיס, דלקת שלפוחית השתן, אבנים בכליות (ליאטיאזיס), גלומרולונפריטיס, קנדידה, נפרופתיה סוכרתית, תסמונת נפרוטית, גידולים, שיכרון מתכות כבדות, זאבת מערכתית, טפילות, פגיעה בכבד ומחלות רבות אחרות הקשורות לשינויים במשקעי השתן.